序號   保護區名稱     區域   面積   主要保護對象

瓊01   永興鳥類  海口市瓊山區     10000 鳥類

瓊02   東寨港     海口市美蘭區     3337   紅樹林生態系統

瓊03   大東海火嶺   三亞市     75  獼猴及其生境

瓊04   甘什嶺     三亞市     1715   無翼坡壘等珍稀植物

瓊05   六道    三亞市     1234   熱帶季雨林

瓊06   三亞河紅樹林     三亞市     344     紅樹林生態系統

瓊07   三亞珊瑚礁   三亞市     8500   珊瑚礁及其生態系統

瓊08   鐵爐港紅樹林     三亞市     292     紅樹林

瓊09   亞龍灣青梅港     三亞市     156     紅樹林生態系統

瓊10   洋浦鼻     洋浦開發區   133     海洋自然景觀

瓊11   白石嶺     瓊海市     747     天然林及自然景觀

瓊12   會山    瓊海市     4462   熱帶季雨林生態系統

瓊13   瓊海麒麟菜   瓊海市     2500   麒麟菜、江蘺、擬石花菜及其生境

瓊14   儋州白蝶貝   儋州市     25800 白蝶貝及海洋生態系統

瓊15   儋州磷槍石島珊瑚礁    儋州市     131     珊瑚礁及其生態系統

瓊16   番加    儋州市     3100   熱帶季雨林生態系統

瓊17   屋基村白鷺   儋州市     25  白鷺及其生境

瓊18   新英灣紅樹林     儋州市     115     紅樹林生態系統

瓊19   名人山鳥類   文昌市     170     鳥類及其生境

瓊20   清瀾    文昌市     2948   紅樹林生態系統

瓊21   銅鼓嶺     文昌市     4400   珊瑚礁、熱帶季雨矮林及野生動物

瓊22   文昌麒麟菜   文昌市     6500   麒麟菜、江蘺、擬石花菜、珊瑚及其生境

瓊23   大花角     萬寧市     106     獼猴及其生境

瓊24   大洲島     萬寧市     7000   金絲燕及其生境、海洋生態系統

瓊25   尖嶺    萬寧市     10899 熱帶季雨林

瓊26   禮紀青皮林   萬寧市     992     青皮林

瓊27   六連嶺     萬寧市     2745   熱帶季雨林

瓊28   南林    萬寧市     5775   熱帶季雨林

瓊29   茄新    萬寧市     7588   熱帶季雨林

瓊30   上溪    萬寧市     11662 熱帶季雨林

瓊31   大田    東方市     1314   海南坡鹿及其生境

瓊32   東方黑臉琵鷺     東方市     1429   "黑臉琵鷺及其生境"

瓊33   獼猴嶺     東方市     12215 熱帶雨林、溶洞

瓊34   花場灣沿岸紅樹林   澄邁縣     150     紅樹林生態系統

瓊35   加連潭     澄邁縣     31  白鷺及其生境

瓊36   彩橋紅樹林   臨高縣     350     紅樹林生態系統

瓊37   臨高白蝶貝   臨高縣     38400 白蝶貝及其生境、珊瑚礁生態系統

瓊38   邦溪坡鹿  白沙黎族自治縣 362     海南坡鹿及其生境

瓊39   鸚哥嶺     白沙、瓊中、五指山、樂東、保亭等市縣    50464 熱帶季雨林生態系統

瓊40   霸王嶺     昌江黎族自治縣、白沙黎族自治縣     29980 黑冠長臂猿及其生境

瓊41   保梅嶺     昌江黎族自治縣 3844   熱帶雨林

瓊42   保國山     樂東黎族自治縣 181     森林生態系統

瓊43   佳西    樂東黎族自治縣 8327   熱帶季雨林

瓊44   尖峰嶺     樂東黎族自治縣、東方市   20170 熱帶季雨林

瓊45   吊羅山     陵水黎族自治縣、保亭黎族苗族自治縣、瓊中黎族苗族自治縣    18389 熱帶雨林

瓊46   南灣獼猴  陵水黎族自治縣 1026   獼猴及其生境

瓊47   黎母山     瓊中黎族苗族自治縣     11701 熱帶季雨林

瓊48   五指山     瓊中黎族苗族自治縣、五指山市   13436 熱帶原始森林

瓊49   西南中沙群島     西沙群島、南沙群島、中沙群島的島礁及其海域    2400000   海龜、玳瑁、虎斑貝及珊瑚礁

瓊50   西沙東島白鰹鳥 西沙群島  100     白鰹鳥及其生境